３９Ｍ （志東地鐵站＜－＞北岸碼頭）
本路線提供志東二村、志東村來往三藩市地鐵站、北岸碼頭之巴士服務，於二零零五年十一月十 五日開辦，以方便志東區乘客轉乘三藩市地鐵或渡輪。
本路線之前身為３７Ａ（志東二村＜－＞北岸碼頭）和３７Ｍ（志東村＜－＞馬場電車總站） （循環線），後因應志東區路線重組，加上路線３７Ａ客量偏低，於二零零五年十一月十五日開辦本路線取代 。當時，通天巴士取消３７Ａ和３７Ｍ之舉動受到市中心區議會反對，所以通天巴士表明新路線車資將調低，最終才獲得通過。本路線自開線以來並沒有太太改動，本身來往志東二村和北岸碼頭，在二零零七年三月十九日配合志東地鐵站運輸交匯處而搬遷；並在二零零七年四月五日延長了服務時間，以方便乘客轉乘地鐵。
由於本路線為志東區唯一一條地鐵接駁路線，加上吸納了舊有３７Ａ和３７Ｍ的乘客，因此本路線自開線以來的客量也非常高。然而，自路線Ｍ３９於二零零六年十一月十三日開辦以後，為地鐵乘客提供免費接駁服務，令本路線之客量流失情況頗大，於繁忙時間只可坐滿，而非繁忙時間更只有十多個乘客。
志東地鐵站在二零零七年四月五日正式啟用，令本路線失去接駁地鐵之作用，通天巴士更考慮將本路線大幅減班和縮短，但受到運輸署和區議會之反對。雖然本路線失去部分地鐵乘客，但由於本路線車資便宜，加上可直接前往市中心區，因此本路線仍有前往市區購物或上班之乘客。同時，自路線Ｍ３９由Ｍ３９Ｐ所取代，本路線之客量再次提升。而本路線還需要接駁渡輪乘客前往地鐵站，因此客量並沒有因此而下跌。即使日後新路線３８Ｍ行駛，預料大部分乘客皆會因為本路線之車資便宜而繼續乘搭。
隨著通天巴士車隊空調化已是大勢所趨，本線在二零零六年六月二十八日加強了空調巴士服務，令到行走本路線的的五部巴士當中，只剩下一部普通巴士並只行走平日繁忙時間，通天巴士更在二零零七年六月一日將該部普通巴士換成空調巴士行走，改為全線空調巴士服務。
值得一提，本路線的北岸碼頭總站，根據區議會地區分界，是屬市中心區，不過總站與金門區相當近，一般市民容易分不清北岸碼頭總站是屬金門區還是市中心區。